sábado 21 de noviembre de 2009

Consejos con Jose (I).

Aunque ando liado con la tesis, que entre hoy y mañana DEBO acabar, os dejo una serie de consejos y recomendaciones:

  • No dejéis todo para el último momento, porque eso es de gente descuidada o de gente que prefiere arriesgar por hacer las cosas más difíciles y peligrosas.
  • No es oro todo lo que reluce, o en mi caso, las colonias blancas no son siempre blancas, y no son siempre las que portan el inserto del gen nifH que estoy intentando codificar. (Consejo Friki).
  • Si hacéis el típico truco de llamaros desde el teléfono de casa al móvil para buscarlo, es mejor no tener el móvil en modo vibrador, aunque es aún más triste cuando lo tienes en modo silencio (sin vibrar ni nada).
  • No es necesario ni cuchillo jamonero ni jamonero para cortar jamón, con un cuchillo de los chinos pueño y cortante, una pared, un mueble y un Jose (lo de Jose se puede cambiar por otro sujeto) es suficiente.
Y por ahora eso es todo, tras este paréntesis, sigo con la tesis... uooo!!! me acabo de percatar, he hecho un "paren-tesis".

martes 10 de noviembre de 2009

Ihhhggghhh!!! (no sé cómo honomatopeyar el esfuerzo que se hace al cagar).

Pués cómo se puede intuir por el título, me encuentro en una situación difícil. Imaginaros que tenéis una par de kilos de mierda (heces para los que son "mu fisnos") llamando a la salida de emergencia, pero esta está bloqueada. Entonces te sientas en tu trono, que para los que viváis cómodos hasta estará limpio y todo, lo cual no quiere decir que el mío dé asco pero... vamos, que no acumula polvo porque a diario le doy uso. Una vez sentados, intentando forzar la salida, IHHHHGGGHHH!!!, aprietas los dientes (con la opción de morderte el labio inferior, el labio inferior de la boca, de la boca que está entre tu nariz y tu mentón, por favor no seáis tan mal pensados) pero el mulatito no quiere salir. Sigues apretando. No sale. Lo vuelves a intentar, agarrándote del lavabo, bidé o bañera para incrementar el esfuerzo. Que no. No sale. Ya te esfuerzas tanto que sientes marearte y desistes. Pues más o menos así es como me siento. Tengo una mierda, realmente es mi tesis, que no es una mierda pero... vamos, es una metáfora, esto lo pongo por si me lee Fernando, mi jefe de Cádiz, y piensa que en vez de seguir escribiendo la tesis (que no sé si el opinará que la llevo bien o mal) me dedico a quejarme y a perder el tiempo con tonterías (¡¡¡en qué momento le di la dirección de mi blog!!!). Pues como iba diciendo, tengo una "mierda" de entre 30 y 60 páginas, de las cuales unas treintayalgo han salido de mi "culo" (=mente, cabeza, cerebro...) pero no logra disgregarse, como las cagadas tipo rosario, y me tiene así de incómodo, con el ojete abierto y sin posibilidad de cambio alguno. Espero en poco tiempo poder alcanzar el lavabo o el mango de la puerta para hacer el último esfuerzo y poder liberarme de ella, pero me temo que hasta al menos una semana eso no pasará. Y lo peor no es la "mierda", sino que se me junta con una "almorrana", unas "agujetas" en la espalda y no sé cuantas cosas más que me dificultan el "envío del fax".
Siento haber sido tan escatológico, pero ya es tarde para sentirlo porque os lo habéis leido todo (y no pongo "comido todo" por no faltar al respeto). Espero no disgustar a nadie y que al menos tanto malestar acumulado os alga echar unas risillas en estos momentos tan duros para muchos.

PD: he escrito en mi blog por mantenerlo activo de alguna manera, y porque ando saturado de la tesis e incluso de la memoria de síntesis (eso sí que es una mierda). Ah! y poner una foto de una... (que no tengo) me parecería de muy mal gusto.

lunes 2 de noviembre de 2009

Por Cádiz, de visita.

El viernes pasado me fui a Cádiz, y tras un viaje de 3 horas acompañado de Nono, hermano de Ricardo, llegué al CASEM, a la facultad, a mi centro de explotación de este año, y donde dije explotación quise decir trabajo pero el subconsciente me traiciona. Nada más apearme del coche, después de aguantar una media de 30 grados centígrados de temperatura, y con una humedad ambiental elevada, yo me sentía como un madrileño recién llegado a la costa. Pegajoso. Asqueado de mí mismo.
Como persona educada donde las haya, fui a avisar a mi explotador (y donde dije explotador quise decir tutor de tesis, pero otra vez me traiciona el subconsciente) que me iba a merendar que luego me reunía con él, a lo que me respondió que no esperaba menos de mí. Después de merendar me reuní no sé si 2 o 3 horas con mi jefe, mi tutor de tesis, y aunque me dí cuenta que me queda mucho trabajo por delante (que en vez de estar haciendo ahora mismo lo he dejado a un lado para publicar esta entrada) la reunión me hizo ver las cosas de otra forma, algo más acertada que la anterior, y supongo que mañana empezaré a batallar de nuevo con la escritura de la tesis de Máster (hoy prefiero descansar y meditar). Tras la reunión ducha y cervezas con Danieu, Jose Pablo (más conocido como Costa Rica), Mercedes, Alberto y unas amigas de los inmigrantes estos que he nombrado antes. Aunque me ofrecieron salir por Muñoz Arenillas, tuve que declinar la oferta porque a la mañana siguiente iba a ir a por setas con los hermanos Bermejo.
Sábado por la mañana, me levanto, estoy en la casa de Carlost, él no está, se fue a... mierda!!!, llevo todo el puente sabiendo a donde pero ahora se me fue de la cabeza, pero sé que es en Irlanda... o Escocia, UF!!!, maldita memoria selectiva!!!. Bueno, pues me levanto, y Costa Rica está en el sofá, él también despierta y nos vamos a desayunar churros con café con leche. Después fui a San Fernando en busca de Ricardo y Antonio Bermejo, mis maestro del arte de la caza de setas con cuchillo. Tras un breve viaje en coche llegamos al coto de caza. Ricardo me cede un arma. Yo la empuño, la pruebo y me la guardo en el bolsillo. Empezamos a andar, y tras un buen rato andando, empiezo a razonar: Si vamos a estar todo el día en el campo... necesitaré agua... y un bocadillo... y...¿por qué no lo he pensado antes?. Justo en ese preciso instante Ricardo me dice: Joseh, veo que no traes mochila. Yo me excuso, diciendo que soy un pardo, que ni lo había pensado y bla bla bla, pero él me sorprende (aunque me lo temía mientras estaba inmerso en mis razonamientos) diciendo que me ha traido un bocadillo, porque se olía que yo no lo iba a traer. ¡¡¡Bendito sea!!!

Pleurotus ostreatus.

Homo sapiens sapiens atacando una manada de Pleurotus ostreatus.

Dos de los tres cazadores, exhibiendo sus presas.

Coccinélido (seguramente lo haya escrito mal, pero la mayoría de vosotros ni lo váis a notar)


El asesinato de una Macrolepiota procera. Se omite las partes sangrientas para no herir la sensibilidad del espectador.

La verdad es que echamos un buen día de campo, con mucho pateo, yo aprendía algo sobre setas y me despejé un poco. Necesitaba un día de campo, después de un mes un poco... intenso emocional y psicológicamente. Además, pasé más tiempo con 2 personas con las que antes no tenía mucho contacto, lo cual, en mi opinión, es bueno. Supongo que hay que aprovechar cualquier ocasión para conocer mejor a la gente y pasar momentos agradables.

Por la noche fui con Helena, Chus y Patri a ver un espectáculo a la plaza de la Catedral. Era una representación teatral un poco rara, hermosa pero difícil de entender. Así que cada uno se monta su película y sigue embobado mirando hacia arriba a los artistas.

Embobás!!! (aunque Chus está posando, ya que fue la que me dijo que hiciera la foto sin avisar)

La mejor foto que saqué del espectáculo. La he retocado un poco, juas juas juas

Vaya cara de gili...

Y luego, después de deleitarme con parte del botín obtenido en el campo, estuve tomando unos cubatas en casa de Mercedes, con Mercedes, Alberto, Juanlu, Helene (como diría Alberto), Ricardo, Nono y un amigo de éstos de cuyo nombre no me acuerdo. La verdad es que echamos un buen rato, viendo cosas sorprendentes en interné, diciendo paridas y hablando de cosas en general. Me estoy dando cuenta de que parece que estoy dando un informe de lo que he hecho a mi jefe o algo así, ¡¡¡ja ja ja!!!. Creo que debería omitir estos pensamientos en mis escritos, y a pesar de que todavía no es tarde porque puedo borrarlos aprentado una tecla repetidas veces (tantas como caracteres que quiera borrar) los dejaré, por que así soy yo de espontáneo.

El domingo por la mañana me estuve visitando mi bar con Helena, para como marchaba el negocio. Como no, las puntillitas siguen estando de miedo, y a pesar de no tener cocacola light ni nestea, el bar sigue funcionando, con sus mismos clientes, mismos camareros, mismas sillas, mismos peces, mismos...muchas cosas. Una de las sensaciones que se repitió en estos días que pasé por Cádiz es que todo sigue igual, que siguen las mismas personas en los mismos sitios, es algo normal pero me resultaba... impactante, no sé por qué. El camarero que más mejor me conoce me dijo que esta vez había llevado a poca gente, y ya le dije que ahora estaba trabajando en Granada pero que para otra vez le traía a más gente. Y así será. Tras tomar un helado y un café me fui a perrear un rato a casa (y donde digo casa me refiero a la casa de Carlost, la casa no móvil de Carlost, como las casas de verdad). Me eché un ratillo y luego libré a Alberto de las cadenas de Mercedes y sus amigas de Utrera para enseñarle a jugar al Pro. He de decir que Alberto es tan malo que graba un video de su mejor gol (y casi el único) con el móvil para fardar y lo graba al revés, desde el final de la jugada al principio. ¡Qué carajote!.
Por la noche, tras cenar y tomar unos cubatas en casa de Patri, nos fuimos de fiesta por Muñoz Arenillas. Esta vez fuimos Alberto, Mercedes, Juanlu (Alberto's best friend), Helena, Chus, Patri y yo. Nos lo pasamos en grande, o por lo menos eso creo yo. No hay documento gráfico de estos momentos porque me quedé sin pilas, o mejor dicho, mi cámara de fotos se quedó sin pilas, o mejor dicho, se agotaron las pilas de mi cámara de fotos. Me suele pasar. Pero bueno, estuvimos en varios sitios, en uno intenté estafar a la camarera para sacar una copa gratis pero no lo logré, demostró algo de inteligencia.

Y el lunes, día estresante, con pocas horas de sueño, una comida con una polaca para hablar de cosas de trabajo, porque ella hizo algo parecido a lo que yo he hecho este año en Cádiz con mi tesis de máster. Después fui a casa de Patri a por mi cámara, a casa de Chus a por unas salsas, a tomar un café, a estar un rato con Chus y a despedirme de ella. Luego a la gasolinera a recoger a mis compañeros de viaje y 3 horas de viaje. Una vez en casa, a perrear con el ordenador (facebook, mesenguer, WOW...) y poner una lavadora. Y ahora aquí estoy, terminando de actualizar mi blog, porque llevaba mucho tiempo sin hacerlo. Y creo que hasta aquí lo voy a dejar. No he entrado mucho en detalle porque no tengo ganas de escribir mucho, pero supongo que con lo que hay es suficiente. Ahora volveré a la cruda realidad: trabajo + tesis = ¿estrés?

Tranquilidad...

sábado 17 de octubre de 2009

Mi primera PCR y algo más.

Hace unos meses la gente se reía de mí porque yo no sabía (o no recordaba) qué es una PCR. Ahora ya lo sé, y sé hacerlas, y las hago. Una PCR, para los que no lo saben, es una técnica para duplicar ciertas cadenas de ADN cientos y miles de veces, para su luego poder trabajar con ellas más comodamente. Lo de ciertas cadenas lo digo porque se duplicarán aquellos fragmentos para los cuales hayas añadido los primers correspondientes en la disolución de la PCR. Bueno, y no me voy a enrollar más con esto, os dejo la foto del gel de agarosa en el que he corrido mis 27 muestras de ADN, con los respectivos patrones de peso molecular y un control positivo.

La foto sale fatal, pero se pueden observar los más de 27 pocillos donde tuve que echar muestra (5 milésimas partes de un mililitro), los patrones de peso molecular y una banda en la segunda columna de arriba que indica que la PCR fue bien.

El lunes someteré a mis muestras resultantes de esta PCR a otra PCR para amplificar aún más el ADN que codifica para la porteína NifH relacionada con la fijación de nitrógeno atmosférico. En esta ocasión en la foto deben verse bandas a la misma altura que el patrón positivo en todas las muestras. Por cierto, casi la cago haciendo la PCR, pero al final mi afán por preguntar y recordar hizo encaminarme hacia el bien. Eso de dejar las enzimas actuar mientras añades las muestras no es recomendable, para otra vez lo tendré más en cuenta.

Y cambiando de tema, ahora estoy liado con la tesis, de nuevo, pero no avanzo mucho. Para la semana que viene quiero dejar la discusión muy avanzada, y la tesis en general, para someterla a una primera y concienzuda revisión por parte de mi(s) jefe(s). Anoche me flipé un poco y he dejado el salón-estudio lleno de gráficas por la pared, como si fuera un poli con un caso complicado (aunque el caso sí que es un poco complicado).

Haciendo que trabajo.

Y poco más que contar, sólo un par de consejos que se me vienen a la mente, no sé por qué:
  • si usas un tenedor para sacar la comida de la sartén en la que la estás friendo, ni se te ocurra luego chuparlo. Está caliente, muy caliente, terriblemente caliente... ¡Quema!
  • si vas a a beber agua de una fuente pública, procura no poner tu cara en la dirección de un hipotético chorro de agua de mucha longitud (hacia arriba). A lo mejor el chorro inicial te moja y no queda muy bien si hay gente delante. Menos mal que no la había.
Eso es todo por hoy. Más y mejor (o menos y peor, o las otras 2 posibles combinaciones de ambas variables) en unos días.

domingo 11 de octubre de 2009

Informe de estado: AVANZANDO.

Aunque me había propuesto terminar hoy la introducción de mi tesis, he alterado mis planes para dejar bien acabados los resultados (me han ocupado 11 páginas). Mañana si me veo con ganas acabo la introducción y empiezo la discusión. Para los que no tengan ni idea de lo que hablo, la tesis de máster tiene que estar estructurada como un artículo científico, y éste se compone de:
  • Título: parece obvio, pero es importante que el título concuerde con el contenido y, en mi opinión, sea corto y conciso. Yo tengo uno provisional que seguramente cambie por otro más conciso. He de consultar a los seres supremos que me avalan. Después del título aparecen el autor o autores del trabajo. Normalmente en este punto se pone en marcha una serie de mafias internas con las cuales... mejor no hablaré, por posibles efectos adversos.
  • Abstract: es un breve resumen del artículo, con una copia en español y otra en inglés. Hasta ahora no había pensado en que lo tenía que hacer, pero aunque eso vaya al principio yo lo dejaré para el final.
  • Introducción (o antecedentes): en este apartado se habla un poco y en general del tema que vas a tratar, y a lo largo de la introducción te vas centrando en tu trabajo y expones todos los conocimientos previos relacionados con éste y que hayan aparecido en otras publicaciones. Normalmente gran parte de esta sección se hace mediante la técnica del copy&paste (no sé si debo decir esto aquí, por si lo lee mi jefe o alguien del Tribunal). Pero aparte del copy&paste hay que darle forma y añadir mucho de tu cosecha. Yo ya tengo gran parte de mi introducción realizada.
  • Material y métodos: consiste en explicar de forma muy técnica todo lo que has hecho, cómo has obtenido los datos, cómo los has tratado y... pues eso, cómo has hecho todo. Esta parte suele estar menospreciada por la gente que tiene que leerse decenas y decenas de papers para escribir su artículo o tesis, pero es muy importante dejar claro cómo lo has hecho para que si alguien quiere compararse contigo que las condiciones sean las mismas o semejantes (o que se tengan en cuentan las diferencias a la hora de comparar). Yo lo tengo completo, aunque falta limar asperezas y ver si se introducirá tratamiento estadístico.
  • Resultados: es exponer y explicar brevemente los resultados. Aquí los iniciados en este mundillo suelen cometer el error de discutir los resultados, pero para eso está el apartado de discusión. Los resultados suelen estar llenos de gráficas y de texto algo tedioso que explica o complementa las gráficas. En mi caso yo me he explayado mucho para favorecer la comprensión del lector. También me falta limar asperezas. Normalmente aquí es donde la estadística hace acto de presencia, ya que a pesar de ser temida y menospreciada por los estudiantes de los primeros cursos de carrera, realmente es necesaria y de uso obligado para darle consistencia y credibilidad a tus datos. Yo... no he metido mucha estadística, así que no sé cuán consistentes y creíbles serán mis datos. Es algo que todavía tengo que mirar y pensar.
  • Discusión: esta es la parte más creativa de todo el trabajo. En este punto es donde discutes, divagas, piensas, comparas y una gran cantidad más de actos de uso de razón e inteligencia son realizados en base a los resultados obtenidos en el apartado correspondiente. Realmente aquí es donde uno empieza a trabajar, ya que mientras los puntos anteriores son puramente descriptivos en éste te tienes que debanar los sesos y exprimir tus fuerzas al máximo para buscar, encontrar y afirmar (o en su defecto hipotetizar) cuales son las causas que provocan los efectos que tu has cuantificado. Además de todo esto, tienes que tener un conocimiento de numerosos trabajos realizados por otra gente y que hayan sido publicados para compararlos con tus resultados, algunas veces apoyarán tus hipótesis y otras las contradirán. Si contradices a alguien, tienes que ser lo suficientemente valiente (o inteligente) como para exponerle una serie de causas o mecanismos o lo que se te ocurra (procurando que sea cierto) que apoye tus datos. Aunque no lo parezca, a mí esta parte me resulta muy tediosa. Seguramente porque acumulo muhcas ideas en la cabeza y me cuesta un poco sacarlas, y más aún compararlas con otros y darles una estructura lógica y acorde con los objetivos del estudio. Como es de esperar, de esta parte apenas tengo 2 páginas y no muy elaboradas, pero cuando me ponga fácilmente rellenaré 10 o más.
  • Conclusiones: según el "procedimiento para realizar el módulo de aplicación" que nos dieron a principios de curso este apartado debe aparecer en un artículo. Hay gente que opina lo contrario, y demasiada gente que no hace uso de este apartado de manera explícita (no sé muy bien lo que significa explícito, pero lo pongo porque queda... culto). Esto me costó unas Franjosé y un litro de Alhambra (o Cruzcampo, no recuerdo, pero creo que fue Alhambra). Aunque parezva mentira al escribir Alhambra me ha venido un olorcillo a cerveza, supongo que mi pituitaria se ha aliado con la parte correspondiente de mi memoria para tentarme. Menos mal que no tengo cerveza... pero... bueno, las botellas de alcohol duro están y seguirán cerradas. Bueno, que me he desviado un poco, pues en conclusiones se pone de forma breve y concisa las 3 o 4 cosas a las que hayas llegado después de mucho divagar en "discusión". A veces las conclusiones están ocultas en el último párrafo de la "discusión", y por eso se omite este apartado. Yo ya haré mis conclusiones cuando disuta.
  • Bibliografía: listado por orden alfabético del primer autor de los artículos, libros, páginas webs o cualquier otro tipo de referencia consultada. Dentro de los apartados de introducción y discusión se indica cuando sea oportuno la bibliografía de la que se han sacado ciertas afirmaciones poniendo el nombre del autor (con o sin el "et al.") y el año de publicación. En la bibliografía se ponen todos los autores, el año de publicación, el título y la revista en la que aparece (con el número de revista y las páginas). La bibliografía es interesante hacerla conforme la vas citando en el texto, que luego al final se te pierden algunos artículos y te vuelves loco para encontrarlos.
Pues así es un artículo. En principio no pensaba extenderme tanto, pero una vez puesto se me van escapando las palabras. Espero que cuando empiece con la discusión la cosa sea más o menos así de fácil y fluida. Por cierto, en nuestro trabajo también se nos permite al inicio poner un apartado de agradecimientos. Para mí será un apartado importante porque a parte de la importancia que tiene agradecer y que todo el mundo (o la parte del mundo que lea tu trabajo) sabrá a quién agradeces y el qué le agradeces, a parte de esto es la parte donde no tienes que guardar ningún tipo de formalidad al escribir, donde eres tu mismo. Por cierto, la gente normalmente lee este apartado porque todos somos un poco marujos. Yo esta parte la escribiré al final, casi justo antes de imprimir.

Y creo que eso es todo, me quedan unos 40 días para entrgar la tesis, pero creo que la llevo bien y que por una vez en la vida podré acabar un trabajo mucho antes de la fecha de entrega (bueno, por segunda vez, porque recuerdo unos perfiles de geología de este año que todos andaban haciendo a última hora menos el que esto escribe). Bueno, y ahora os dejo con unas fotos que hice antes de empezar a escribir esto, y que eran la causa por la cual iba a publciar una entrada, pero al final me he liado y ha salido más de lo que esperaba. Espero que los no científicos les haya gustado saber cómo se estructura un artículo científico (y si no les ha gustado pues se quedarán con ese conocimiento, ja ja ja). También espero que los sí científicos, que son muchos los que andan por aquí, este repasito de cómo se estructura un artículo científico les haya servido para algo, aunque sólo sea para echar unas risas o asentir con la cabeza pensando: ¡Pues sí!, Tiene razón. ¡Ay Joselito! ¡Cuánto sabes!. Bueno que me enrollo otra vez, os dejo las fotos:

¡¡¡Gran lío de cables!!! O, como yo lo llamo, desorden ordenado. Están los cables de la lámpara, la impresora, el ordenador, el módem y los altavoces a la red eléctrica por un lado. Por otro los del ratón, el USB a mi MP4, el USB a la impresora, el del módem al ordenador, el del módem a no sé donde, el del teléfono, el de los altavoces al ordenador (o al MP4), el USB de la memoria extraible y... creo que ninguno más. También se aprecia en la foto uno de mis muchos cuadernos de guarreo y alguno de mis numerosos papeles de notitas e ideas. Y si te fijas muy mucho verás que soy un máquina jugando al Catán y que no hay quien me gane.

TRABAJO...

...DESCANSO...

...y AÑORO.